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primer premier是一款基因分析软件,其是加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计和评估程序。其包含序列编辑窗口、引物设计窗口、酶切分析窗口和纹基分析窗口四个界面窗口，其分别为用户提供引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA基元查找和同源性分析功能。primer premier还可针对面板DNA的来源以相应的遗传密码规则转换DNA和氨基酸序列，它给出了八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择，例如纤毛虫大核、无脊椎动物线粒体和支原体等。此外，primer premier还有一些特殊功能，包括设计简并引物、序列"朗读"、DNA 与蛋白序列的互换和语音提示键盘输入等。
下载地址：http://www.cityhbs.com/thread-1418-1-1.html
软件特点
1、primer premier主要界面是分为序列编辑窗口（Genetank），引物设计窗口（Primer Design），酶切分析窗口（Restriction Sites）和纹基分析窗口（Motif）
2、primer premier破解版就是用来进行引物设计的
3、可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物
4、primer premier在手动的任何时候，下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异 二聚体、发夹结构等。也可以给定条件，让软件自动搜索引物，并将引物分析结果显示出来
5、操作非常简单，只需简单的几部即可实现引物设计
八种生物亚结构
1、纤毛虫大核（Ciliate Macronuclear）
2、无脊椎动物线粒体（Invertebrate Mitochondrion）
3、支原体（Mycoplasma）
4、植物线粒体（Plant Mitochondrion）
5、原生动物线粒体（Protozoan Mitochondrion）
6、一般标准（Standard）
7、脊椎动物线粒体（Vertebrate Mito-chondrion）
8、酵母线粒体（Yeast Mitochondrion）
primer premier使用技巧
一、限制性酶切点分析及基元查找功能
1.其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析及基元查找功能比较简单，点击该功能按钮后，选择相应的限制性内切酶或基元（如-10 序列，-35 序列等），按确定即可
2.常见的限制性内切酶和基元一般都可以找到,你还可以编辑或者添加新限制性内切酶或基元
二、引物设计
1.打开DNA序列后点击按钮primer，出现“search criteria”窗口，有多种参数可以调整
2.搜索目的（Seach For）有三种选项，PCR 引物（PCR Primers）、测序引物（Sequencing Primers）和杂交探针（Hybridization Probes）
3.搜索类型(Search Type)可选择分别或同时查找上、下游引物（Sense/Anti-sense Primer，或Both），或者成对查找（Pairs），或者分别以适合上、下游引物为主（Compatible with Sense/Anti-sense Primer）。另外还可改变选择区域（Search Ranges），引物长度（Primer Length），选择方式（Search Mode），参数选择（Search Parameters）等等
3.使用者可根据自己的需要设定各项参数。如果没有特殊要求，建议使用默认设置。然后按search，随之出现的Search Progress 窗口中显示Search Completed 时，再按OK，这时搜索结果以表格的形式出现，有三种显示方式，上游引物（Sense），下游引物(Anti-sense)，成对显示(Pairs)。默认显示为成对方式，并按优劣次序（Rating）排列，满分为100，即各指标基本都能达标
三、引物点击
1.点击其中一对引物，如第1#引物，并把上述窗口挪开或退出，显示“Peimer Premier”主窗口，所得结果分三部分，
2.模板及产物位置，中间是所选的上下游引物的一些性质，最下面是四种重要指标的分析，包括发夹结构（Hairpin），二聚体（Dimer），错误引发情况（False Priming），及上下游引物之间二聚体形成情况（Cross Dimer）
3.当所分析的引物有这四种结构的形成可能时，按钮由变成，点击该按钮，在左下角的窗口中就会出现该结构的形成情况
4.一对理想的引物应当不存在任何一种上述结构，因此最好的情况是最下面的分析栏没有，只有。值得注意的是中间一栏的末尾给出该引物的最佳退火温度
四、引物修饰编辑
1.在需要对引物进行修饰编辑时，如在5’端加入酶切位点，可点击，然后修改引物序列
2.若要回到搜索结果中，则点击按钮。如果要设计简并引物，只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述的八种遗传密码规则，反推至DNA 序列即可3.对简并引物的分析不需像一般引物那样严格
4.总之，“Premier”有优秀的引物自动搜索功能，同时可进行部分指标的分析，而且容易使用，是一个相当不错的软件