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你要计算什么?加减乘除?还是求平均数?
准备工作:
点击excel“工具”项下的“加载宏”,里面有一个选项是“分析数据库”。在前面加上钩。点击“确定”。这样你就安装好了“分析数据库”。成功之后,"工具"菜zd单下将出现"数据分析"这一栏目。一定要确保有这个“数据分析”项内目的出现。
1、先将化合物浓度取以10为底的对数。使用excel中的函数:LOG10.
2、 将抑制率转化为概率单位。具体做法是:在“统计”一栏中,取函数NORMSINV()+5.
3、 以"概率单位"为Y,以"浓度对数"为X,在“工具”栏的“数据分析”项目下点击“回归”,求得回归方程.
4、当抑制率为50%时,概率单位=5.将5代入回归方程,可求得抑容制率为50%时化合物浓度的对数.将浓度对数转化为浓度(使用函数POWER),即为IC50.
先把数据zhidao导入Origin,然后从菜单选择Analysis:Non-Linear Curve Fit:Advanced Fitting Tool打开非线性拟合的工具.用Dose Response函数去拟合曲线.这样你可以得内到log10这个参数的值.IC50可以用容以下公式计算:
IC50=10^log10
操作系统和配色方案:WIN7 Home Basic
· 屏幕分辨率:1024×768
· 数据处理软件
- Microsoft OfficeExcel 2010
- IBM SPSSStatistics 19【可计算IC50】
- GraphPad Prism 5【可计算IC50,本讲推荐】
- Origin8.5.1
任务:绘制量效曲线,计算IC50
IC50:半数抑制浓度(对应左图),Y轴的研究指标随浓度递减。
EC50:半数有效浓度(对应右图),Y轴的研究指标随浓度递增。
右图其实是把Cell Inhibition当成药物的效应,与药物浓度呈正相关。
其实对于细胞毒实验,两者是相等的。
如果药物有抑制细胞活性的作用,习惯上称之为IC50(称呼而已)。
【实例操作1】细胞毒实验计算IC50
· 细胞毒实验:SRB法,MTT法
· 阴性对照组Concrol:给药浓度为0的含细胞的孔,实验中以该组细胞活力当成100%。
· 空白组Blank:无细胞的孔,用于吸光度的调零(扣掉e68a84e799bee5baa6e79fa5e9819333396孔板自身的一点儿吸光度)。
拓展知识:计算IC50的其他方法
方法1:前面已演示,用Excel计算Mean,SD和N,转换成百分数后用GraphPad计算。注意选择normalized Response-Variable slope。
方法2:XY→Use sample data→Dose response,直接将吸光度值输入GraphPad近似计算。选择response-Variable slope。【快速,但有近似,有主观成分】
方法3:使用SPSS,分析→回归→Probit。
方法4:使用Excel,对中间呈线性的几个点进行线性拟合,用线性方程来近似计算。【简易,但有近似,有主观成分】